1、時間短、速度快傳統(tǒng)的熱殺菌是通過熱傳導(dǎo)、對流或輻射等方式將熱量從食品表面?zhèn)鞯絻?nèi)部，要達到殺菌溫度，往往需要很長時間。微波殺菌是微波與食品及其細菌等微生物直接相互作用，熱效應(yīng)和非熱效應(yīng)結(jié)合在一起，達到快速降溫殺菌的目的，處理時間大大縮短，對各種材料的殺菌一般在3-5分鐘。
2、低溫殺菌保持了傳統(tǒng)風(fēng)味的營養(yǎng)成分和微波殺菌是通過特殊的加熱和非熱效應(yīng)殺菌，與傳統(tǒng)的熱殺菌相比，可以在較低的溫度和較短的時間內(nèi)獲得所需的殺菌效果。一般殺菌溫度在75-80攝氏度，可以達到效果，除了微波加工食品還可以保留更多的營養(yǎng)成分和色、香、味、形等風(fēng)味，具有膨脹性效果。
3、節(jié)能傳統(tǒng)的熱殺菌往往是在環(huán)境和設(shè)備上有熱損失，而微波是直接對食品，所以沒有額外的熱損失。相比之下，它通常可以節(jié)省30%到50%。
4. 均勻徹底的常規(guī)熱滅菌從材料表面開始，通過熱傳導(dǎo)到內(nèi)部，內(nèi)部與外部存在溫差。保持風(fēng)味，縮短加工時間。食品內(nèi)部溫度往往達不到足以影響殺菌效果的程度。由于微波能起到穿透作用，在對食品進行整體加工時，表面和內(nèi)部同時作用，所以消毒滅菌均勻徹底。
5、易于控制的微波干燥操作滅菌處理，該設(shè)備可立即使用，沒有傳統(tǒng)的熱滅菌的熱慣性，操作靈活方便，微波功率可調(diào)，傳輸速度從零開始連續(xù)可調(diào)，操作方便。和傳統(tǒng)方法相比，微波設(shè)備不需要鍋爐、復(fù)雜的管道系統(tǒng)、煤場和運輸車輛，只要具備基本的水電條件即可。