關于高壓脈沖電場的滅菌機制主要是電崩解和電穿孔理論。電崩解理論是基于外加電場使細胞膜穿孔化破裂，使細胞膜結構紊亂和通透性大大提高，并使胞內液體流失，膜內各生物酶活力受到影響，終導致細胞徹底死亡。電穿孔理論是基于高壓電脈沖會改變脂肪的分子結構并增大蛋白質通道的開放度，蛋白通道打開后，大量電流就會通過，遠遠超過正常的生理狀態，細胞膜失去半滲透性，導致細胞膨脹而死。

一般來說，電場強度、脈沖寬度和脈沖個數增加時，細菌殘活率隨之降低。但不同菌種對電場的耐受力不同，所以當外界條件相同時，細菌殘活率由大到小依次為枯草芽孢桿菌＞金黃色葡萄球菌＞大腸桿菌＞沙門氏菌。同時，相同菌種所處的生長周期對滅菌效果也有影響，處于對數生長期的菌體比處于穩定期的菌體對電場更為敏感，菌落數高的樣品比菌落數低的樣品滅菌效果更明顯。

高壓脈沖電場滅菌具有處理時間短、耗能低、升溫小、滅菌率高、不影響藥物的有效成分等顯著優點，是一種安全有效的冷殺菌技術，今后應開展進一步研究使其應用更加規范化、標準化，向工業大生產方向推進。

低溫等離子體滅菌法

等離子體是氣體在加熱或強電磁場作用下產生的，主要由電子、離子、原子、分子、活性自由基及射線等組成，被稱為繼固態、液態、氣態以外的新的物質聚集態，即物質第四態。由于等離子體滅菌技術尚處在研究階段，因而對其殺菌機制還沒有公認的理論。在等離子體產生過程中，由于輝光放電，可放出大量紫外線和活性粒子（如O、OH、NO2），這些被認為在滅菌過程中起了主要的作用。

等離子體滅菌作為一種新興的滅菌方法，其主要特點：（1）滅菌溫度低；（2）滅菌速度快，一般在幾分鐘到幾十分鐘內就可達到滅菌效果；（3）不產生副產物，不產生有毒殘留物，對環境和操作人員安全；（4）滅菌全面，如高頻空間等離子體可以對藥物的各個角度進行有效滅菌。相對于傳統高溫滅菌，低溫等離子體滅菌有許多優點，尤其表現在對熱敏性藥材的滅菌過程中。